Ud notará que existen 6 directorios cuando ud entra por FTP a su sitio:
etc - Aquí se guarda información de quotas passwords favor no tocarlo
public_ftp - Este direcorio es para el FTP anonimo (solo sirve con cuentas que tienen IP fijo)
public_html - Este es el directorio donde deberá subir sus páginas web.
www - Este directorio es solamente un link simbolico es el mismo public_html .
mail - Aquí es donde se almacena su correo. NO LE CAMBIE los permisos a este directorio o su correo dejará de funcionar.
tmp - Este directorio guarda información miscelanea. Información de estadisticas, NO LE CAMBIE los permisos o dejaran de funcionar.
Para más informacion ver: